BIOgarabatos

 Estamos a punto de emprender una nueva aventura, el 7 de agosto iniciará el curso de investigación digital que imparto en el Posgrado de Ciencias Médicas de la UNAM para los estudiantes de maestría del semestre 2024-1, cada semestre en formato virtual probamos nuevas herramientas, aprendemos nuevos procedimientos y monitoriamos los temas en boga sobre información e informática en ciencias médicas como bases de datos, metadatos, publicación, metaciencia, ciencia abierta, etc... INSTITUTO NACIONAL DE CIENCIAS MÉDICAS Y NUTRICIÓN “SALVADOR ZUBIRÁN Asignatura: INFORMÁTICA PARA LITERATURA EN CIENCIAS MÉDICAS PARTE 1 Clave: 69761  Grupo: NUT1 Créditos 4 El curso será los martes de 8:00 a 10:00 Presentación Si estás inscrito en el curso recibirás un correo y una invitación a la clase por el calendario de Google. Este semestre estaré realizando una investigación digital sobre los hospitales de México, vamos allá! Fechas importantes Inscripción vía internet  www.saep.unam.mx –...

 Uno de los problemas a los que nos enfrentamos los profesores de Educación Superior en la enseñanza actual tiene que ver con el carácter fijo de los planes y programas de estudio, no solo eso, modificarlos, transformarlos, actualizarlos y modernizarlos, resulta complicado, complejo y tardado. Además, es necesario considerar lo atrasadas que están las normativas y lo enredado que resultan los trámites administrativos para generar cambios significativos. Otra complicación es que migrar a una enseñanza virtual dinámica, innovadora y de vanguardia depende de los propios profesores, pues somos los que diseñamos los nuevos planes de estudio, pero tenemos la desventaja de que son muy pocos los académicos que usan con fluidez, y menos  aún menos los que dominan las TICs para investigación y enseñanza. De tal forma que, estamos atrapados en un círculo vicioso que hará lento, complicado y difícil tener una enseñanza virtual moderna de manera inmediata. Tenemos que ver la forma de respo...

 Hace algunos meses publiqué un artículo sobre el uso de Twitter en biociencias en el que explicaba, de manera general, todas las ventajas que tenía para acceder, encontrar y compartir información científica, tanto que era mi fuente de investigación digital principal sobre biodatos, herramientas electrónicas académicas y biocolores. Poco tiempo después, en noviembre del 2022, todo cambio, la compañía fue vendida y fue evidente que eso sería un desastre, porque la moderación se salió de control, se cobró la verificación, se generaron cuentas que tendrían privilegios previo pago, se elimino la API, se limitaron los mensajes que se pueden leer, se restringió el acceso solo a los usuarios registrados, de tal manera que los twitts ya no son públicos y por último, se le cambió el nombre, Twitter ya no existe mas. Esta será una gran pérdida para la comunidad científica, en especial para tofos aquellos que utilizaban esta red como canal de comunicación principal. La reacción de los académi...

Dentro de la Biología del color se han publicado interesantes artículos que tratan exclusivamente sobre un color en los seres vivos, estoy resultan interesantes por que se centran en los diversos temas al rededor de un solo tono, veamos algunos a continuación.  Blanco Igic, B., D’Alba, L., & Shawkey, M. D. (2018). Fifty shades of white: How white feather brightness differs among species. The Science of Nature, 105(3), 18. https://doi.org/10.1007/s00114-018-1543-3 Negro McCoy, D. E., & Prum, R. O. (2019). Convergent evolution of super black plumage near bright color in 15 bird families. Journal of Experimental Biology, 222(18), jeb208140. https://doi.org/10.1242/jeb.208140 Rojo Davies, K. M., Landi, M., Van Klink, J. W., Schwinn, K. E., Brummell, D. A., Albert, N. W., Chagné, D., Jibran, R., Kulshrestha, S., Zhou, Y., & Bowman, J. L. (2022). Evolution and function of red pigmentation in land plants. Annals of Botany, 130(5), 613-636. https://doi.org/10.1093/aob/mcac109 A...

La mejor manera de entender  la ciencia real es a través de estos grandes comics que explican de manera muy clara y divertida como funciona la ciencia actual. siempre vale la pena seguirlos y reflexionar sobre las ideas que exponen. Además, por supuesto resultan en conversaciones con colegas francamente constructivas y entretenidas, que por cierto, ayudan muchas veces a desahogarse de la horrible realidad que vive la ciencia en nuestra región. Estos son dos de mis comics de ciencia favoritos: https://xkcd.com/ https://phdcomics.com/ Fuente de la imagen: https://imgs.xkcd.com/comics/types_of_scientific_paper.png

La publicación científica está en crisis, nadie lo duda, es un mal necesario pero mientras no tengamos una mejor alternativa seguiremos usando este sistema obsoleto de comunicación científica. Estamos tan concentrados y presionados en publicar, que no estamos enfrentando el problema y tardaremos en resolverlo, aquí algunos artículos recientes que ponen el dedo en la llaga.  hmed, A., Al-Khatib, A., Boum, Y., Debat, H., Gurmendi Dunkelberg, A., Hinchliffe, L. J., ... & Pruszynski, J. A. (2023). The future of academic publishing . Nature Human Behaviour, 1-6.  https://www.nature.com/articles/s41562-023-01637-2 Brembs Björn, Huneman Philippe, Schönbrodt Felix, Nilsonne Gustav, Susi Toma, Siems Renke, Perakakis Pandelis, Trachana Varvara, Ma Lai and Rodriguez-Cuadrado Sara 2023 Replacing academic journals R. Soc. open sci.10230206230206 http://doi.org/10.1098/rsos.230206 Sabel, B. A., Knaack, E., Gigerenzer, G., & Bilc, M. (2023). Fake Publications in Biomedical Science: ...

 En junio del 2023 terminamos el primer curso de  Ciencia, tecnología y sociedad: La información  para la carrera de Física Biomédica de la Facultad de Ciencias de la UNAM en su primera versión.  El Grupo   3062  del semestre versión 2023-2 tuvo 13 alumnos inscritos, tuve el gusto de estar acompañada por las profesoras Paulina Cruz Castañeda y Minerva María Romero Pérez. La clase fue virtual, la impartimos los miércoles de 16:00 a 18:00 horas y fue una gran experiencia, porque tuvimos un curso dinámico y muy enriquecedor, en el que probamos distintas herramientas digital e implementamos diversos. Planeamos repetir el curso mejorado en el 2024-2, ahí nos vemos. Fuente de la imagen:  https://www.wikiart.org/en/olga-rozanova/four-aces-simultaneous-composition-1916

Cuándo uno realiza una investigación se concentra en el tema de estudio y todo lo ve bajo esa lupa, esto implica ponerse unos lentes para identificar todas las repercusiones de un tema y actuar como detective para interpretar el mundo desde esa perspectiva, le sucede igual lo mismo escritor cuando está recopilando información, para escribir un libro o a un estudiante que está aprendiendo un nuevo tema o a un investigador que está trabajando un proyecto para obtener nuevo conocimiento sobre un objeto o fenómeno. Evidentemente ese es el enfoque cotidiano que realizó cuando estoy realizando investigación digital, en el que proceso constantemente información por medio de la curación de contenidos digitales que servirán como fuentes para mi investigación, todo esto lo interpreto a través de los lentes de la investigación digital concentrada en la bioinformación, esto es,  en las características y cualidades de la información, cómo se procesa, cómo se puede estructurar, qué procedimiento...

La inteligencia artificial (IA) se refiere a la simulación de procesos de inteligencia humana mediante la programación de algoritmos en computadoras y sistemas informáticos. En otras palabras, es la capacidad de las máquinas para realizar tareas que normalmente requerirían la inteligencia humana, como el aprendizaje, la resolución de problemas, la comprensión del lenguaje humano, la toma de decisiones y la percepción visual. La IA se basa en la idea de crear sistemas informáticos complejos, integrados y autosuficientes. Esta tecnología está asociada a otras innovaciones como el Aprendizaje Automático (Machine Learning), Las redes neuronales artificiales, el Procesamiento de Lenguaje Natural (NLP), la robótica, los sistemas expertos y la visión por computadora. Es una tecnología transformadora con un potencial significativo en campos como la medicina, la educación, la industria, el transporte, el biodiseño y la investigación científica.  Fuente de la imagen:  https://botsin.spa...

Wikidata tiene un gran potencial para producir aplicaciones, estas son herramientas que han diseñado los usuarios basados en la información que indexa la plataforma para generar análisis y visualizaciones que son dinámicas, automáticas, y abiertas veamos algunas de las que más me gustan: https://wikipulse.com/ https://scholia.toolforge.org/ https://wikxhibit.org/ https://isobelm.github.io/Software-Engineering/#/ https://dataviz.toolforge.org/ Fuente de la imagen: https://www.wikiart.org/en/olga-rozanova/non-objective-composition-suprematism-1

 Encuentro constantemente proyectos basados en las aplicaciones de la Fundación Wikimedia  que son creativos e interesantes, les comparto algunos que considero realmente útiles y hermosos https://inventaire.io/welcome https://www.kiwix.org/es/ http://listen.hatnote.com/ https://grafana.wikimedia.org/d/O_OXJyTVk/home-w-wiki-status?orgId=1&refresh=30s Fuente de la imagen:  https://commons.wikimedia.org/wiki/Portada#/media/File:Alcedo_atthis_-_Riserve_naturali_e_aree_contigue_della_fascia_fluviale_del_Po.jpg

Mi programa de televisión favorito, sin duda alguna es La dichosa palabra , aunque hace muchos años que no tengo televisión, el formato en línea me permite sintonizarlos a través de las grabaciones de Youtube, que puedo ver y oír sin cortes comerciales. Por cierto, hablando de palabras, nos hace falta una que haga referencia a la acción combinada de ver y oír, que hacemos muy frecuentemente cuando atendemos a los videos, tan visitados actualmente. Esta transmisión semanal que dura varios meses a través de temporadas anuales se empezaron a transmitir en 1996?, es un programa de palabras sobre palabras que es ameno, divertido, interesante e inteligente. Abajo anoto la lista de los videos del más antiguo al más reciente de todas las temporadas, falta la 5 que no la encuentro en ninguna parte. Temporadas Temporada 21:  https://youtube.com/playlist?list=PLHXFQrHFFd_XACEWfKj7pHJhVY297cFsy Temporada 20:  https://www.youtube.com/playlist?list=PLHXFQrHFFd_WR7fyx5vMMz6PeyLREYga_ Tempora...

Introducción La ciencia tiene muchas barreras, históricamente ha sido una actividad elitista, estos impedimentos pueden estar dados por la región, el país, el nivel económico, y afecta principalmente a comunidades con rezagos como los pueblos originarios, la comunidad LGTB, las mujeres, minorías, etc.. Una de esas barreras infranqueables hasta hace poco fue el idioma. Ahora, la buena disposición de la comunidad científica y la tecnología disminuirán esta brecha con propuestas como la infodiversidad, la bibliodiversidad y la promoción del multilinguismo contra la hegemonía del inglés en la ciencia. Por supuesto que es necesario el uso de un lenguaje común, pero con la versatilidad del multiculturalismo incluido. Una de las ventajas de la investigación digital es que no hay barreras idiomáticas, pues en la versión digital se puede traducir casi todo con una aceptable calidad, que usando el contexto, el sentido común y la Tecnología. Leer. escribir y hacer ciencia en un idioma distinto es...

No uso facebook, hay demasiada publicidad y chisme, Twitter era bueno pero se convirtió en toda una decepción, así que ahora solo utilizo la red social de Mastodon. La zona en la que vivo no tiene servicio de Internet, ni celular, por obvias razones necesito un buen servicio de acceso a la Web y la mejor opción era Starlink. En el proceso para informarme sobre las bondades, o no, de este servicio una de las pocas fuentes de información social de esta empresa, ademas del portal oficial es un grupo de facebook en el que los usuarios exponen noticias, experiencias y preguntas sobre el servicio. Me uní a este grupo y la experiencia fue realmente reveladora. Antes de exponer los detalles debo agregar que estoy poco expuesta a grupos de este tipo pues controlo mucho la información que consumo, pues trato de asegurarme de acceder siempre a fuentes fiables y actualizadas. Fue realmente una sorpresa la dinámica de ese grupo, pues claramente reina la confusión, dado que no es un grupo oficial, n...

En mi opinión uno de los grandes problemas que tenemos con la enseñanza en línea actualmente es la reticencia y el miedo que nos genera adoptar la versión digital para enseñanza e investigación de manera activa, permanente y definitiva en la práctica académica cotidiana, estamos lejos de adoptar culturalmente  el uso de las herramientas informáticas de manera robusta e integral , pues en la mayoría de los casos las aplicamos de manera incompleta y aislada. Durante la pandemia tuvimos la gran oportunidad de integrar el formato virtual a nuestra vida profesional, pero el gran impacto que nos generó el tener que implementar herramientas tecnológicas que no estábamos acostumbrados a utilizar y hacerlo de manera inesperada y rápida como respuesta a la emergencia represento para los muchos  no acostumbrados a la experiencia digital, una una experiencia abrupta y traumática. Además, está el elemento nada despreciable de qué estábamos viviendo una emergencia,  nuestra vida estaba...

#educatic2023 se llevará a cabo del martes 25 al viernes 28 de julio El programa #educatic2023   Estoy lista para participar en #educatic2023, en esta entrada les iré contando mis impresiones. Tomaré dos talleres : 1. La imagen y tratamientos gráficos para su aplicación en recursos educativos. Martes 25 de julio de 10:00 a 12:00 hrs. 2. Incorporación de las TIC en los planes y programas de estudio de la UNAM. Jueves 27 de julio de 18:00 a 20:00 hrs. Fue una reunión interesante, la plataforma funciona mucho mejor que el año pasado, las conferencias están disponibles en línea y las secciones de mi interés como las de biología, medicina y literatura tuvieron buenas ideas. Fuente de la imagen:  https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/16/Frostedbubble2.jpg/480px-Frostedbubble2.jpg

En algunos países de Europa y en Estados Unidos, en los que los ciudadanos tienen oportunidades, tiempo recursos y la disposición para hacer investigación, es común ver la realización de lo que yo denomino ciencia comunitaria, ciencia activa y dinámica que se hace a través de la colaboración de distintos actores como académicos, estudiantes, bibliotecarios y ciudadanos con un gran impacto social. Este fenómeno lo he identificado por su amplia difusión en redes como Twitter y Mastodon y representa una forma interesante de hacer ciencia utilizando las plataformas digitales.  Pronto iré agregando ejemplos de este tipo de proyectos que me parecen sumamente inspiradores. Fuente de la imagen: https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Bessen_van_een_Ophiopogon_planiscapus_%27Niger%27._28-02-2023._(d.j.b).jpg

Hacer investigación comúnmente está asociado a que el investigador este adscrito a una institución académica como profesor, curador, investigador o incluso médicos y el personal de salud. Pero la revolución digital ha disparado fenómenos interesantes que han modificado profundamente la manera de hacer ciencia como la investigación independiente y la ciencia ciudadana. Veamos algunos detalles sobre la primera. Hacer investigación académica implica generar nuevo conocimiento sobre algún tema, consiste en ser un especialista, dominar los términos, conceptos y métodos, conocer la literatura especializada y publicar artículos científicos. Realizar todo esto, actualmente es fácil en un contexto digital, porque no es necesario pertenecer a una institución académica para hacer investigación y publicar los resultados en las revistas arbitradas de calidad. La investigación digital promueve este tipo de investigación en la que no es necesario tener un título, una adscripción o cualquier otro tipo...

Dentro del proyecto denominado "Código salud" hemos estado curando información sobre los hospitales de México en Wikidata para agregar información estructurada que permita tomar decisiones, una de las variables de nuestro interés son los tratamientos que se pueden realizar en estos nosocomios, en especial los que salvan más vidas como: infarto agudo al miocardio e infarto cerebral. Recientemente hemos detectado que sería factible agregar información sobre los hospitales que realizan transplantes en el país, veremos cuál es la mejor forma de hacerlo, por ejemplo sería interesante agregar los hospitales que realizan los transplantes, los órganos transplantados, el tipo de  hospital, etc... Aquí ire reuniendo algunas fuentes primarias sobre el tema: https://datos.gob.mx/busca/organization/cenatra Fuente de la imagen:  https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/1/12/CG_Heart.gif/480px-CG_Heart.gif

Esta es una lista de enfermedades que están asociadas a la coloración o la visión del color y que resultan de interés para investigación en biociencias: Coloración -Albinismo -Vitiligo -Melanoma Visión del color -Daltonismo Fuente de la imagen:  https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Ishihara_9.svg

Una de las habilidades más importantes que debemos fomentar para todos y siempre es dar una opinión, está es una habilidad esencial para los estudiantes de educación superior en formación, pero especialmente para los de ciencias que son los que se forman en la Facultad de Ciencias de la UNAM . Para formar una opinión es necesario procesar la información, sintetizarla, integrarla, contextualizarla y expresarla con fluidez y claramente, de tal manera que sea bien fundamentada y se puedan argumentar las implicaciones de esta, tanto en favor y en contra. Es una hábito que para dominarlo se debe practicar constantemente, escuchando y atendiendo a los interlocutores, generando la opinión, compartiéndola y dialogándola. En este proceso resulta muy útil tomar notas con las ideas clave, para facilitar la integración y el orden de la exposición de una opinión en formato escrito y oral. Esta es sin duda una de las competencia básicas que fomentamos en el Laboratorio de BIOinformación . Fuente...