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Mostrando entradas de enero, 2023

El laboratorio de Bioinformación

En el Laboratorio de  Bioinformación hacemos investigación digital para estudiar los biodatos, la bioinformación y la bioliteratura. Hago biología   in silico  a partir de la intersección entre   las biociencias , la  información y la informática . Para hacer todo esto hago experimentos en  Biología del Color,  de tal manera que aquí narraré las experiencias que realizo durante mis actividades de investigación, enseñanza, gestión y difusión. Estudio la información, ahora utilizo color en los seres vivos para entender y explicar los fenómenos acerca de los biodatos, la bioliteratura y la bioinformación como los siguientes: De qué manera se comparten los datos, la información y las ideas en la era digital Cuál es su ciclo Cuales son las diferentes maneras de representarlos Cómo se estructuran semánticamente Cuáles son las mejores herramientas para procesarlos y obtener visualizaciones sobre relaciones, dinámica, tendencias y patrones

10 iniciativas para Biologia Comparada

Diez iniciativas de ciencia que todo investigador de biología comparada debe conocer e implementar en su práctica académica La ciencia es dinámica, evoluciona produce novedades continuamente, muchas de esas innovaciones y mejoras tienen que ver con la propia práctica académica. Sesiones en línea para explorar, aprender e implementar  Una vez por semana Una hora Día y horario por definir Son 10 iniciativas sobre las cuales conversaremos y probaremos, la idea es abrir un espacio en el que podamos compartir y probar todas las novedades en ciencia, con énfasis en las que sean más útiles en las biociencias y la biología comparada que puedan ser de nuestro interés. Metadatos, especificaciones e identificadores: DOI (Objetos Digitales) ORCID (Identidicador de autores, Google Scholar y Bionomia (Identificador de taxónomos que han descrito nuevos taxones) Metaciencia: Temas que tienen que ver con la manera en la que hacemos ciencia en la actualidad, por ejemplo  DORA (La Declaración sobre Eval

Curso de historia y filosofía de la biología 2023-3

En el 2023 me toca junto con la historiadora de la botánica Graciela Zamudio impartir el curso de historia y filosofía de la biología ( https://sites.google.com/bioinformacion.org/lab/cursos/fhb ) de manera intensiva durante tres semanas en modalidad presencial. Una reflexión importante que hacemos científicos tiene que ver precisamente sobre qué es la ciencia como hacemos investigación como generamos conocimiento información y datos sobre nuestro objeto de estudio la historia de la ciencia precisamente trata de entender cómo es que se han hecho la ciencia de diferentes maneras, cuáles son las aproximaciones, cuáles son los principales problemas que se han abordado, cuáles han sido las principales preguntas que se han generado y cómo se han resuelto. Además, vale la pena reflexionar sobre cuál es la importancia de la historia y la filosofía de la ciencia para los científicos. Estos temas vistos a través de la historia de la biología es lo que discutiremos durante el curso. Abajo les de

Análisis métricos para historia digital de la ciencia

 Los análisis métricos de la información, también llamados bibliometría, cienciometría, infometría y altmetría se han utilizado frecuentemente para hacer investigar la historia de la ciencia desde la perspectiva de la publicación científica, este enfoque permite entender las distintas dimensión del producto científico por excelencia, los artículos científicos.     Los artículos científicos constituyen el insumo y producto de la práctica científica, reflejan prácticas académicas, sociales y culturales como la revisión por pares, la ciencia abierta, el acceso abierto, la reproducibilidad, el manejo de los datos y código, la implementación de la tecnología, e incluso buenas y malas prácticas como el plagio y las revistas depredadoras, todas estas dimensiones se integran en lo que ahora se denomina metaciencia.      En esta colección de artículos sobre Historia Digital he reunido las publicaciones de interés para historia de la ciencia que implementan procedimientos y herramientas digital