BIOgarabatos

Hasta ahora la inteligencia artificial de texto generativa se basa principalmente en el modelo de lenguaje basado en procesamiento, son robots que se dedican a procesar y reescribir el lenguaje natural disponible en la Web. Pero la tecnología de la información actualmente está desarrollada mucho más que eso, ahora el reto es producir información estructurada y semántica, de tal manera que, sea posible generar nuevo conocimiento a partir de la información con significado que se ha creado en la web semántica, hacia allá vamos. Para explicar esto mas claramente, podría usar la alegoría de qué en lugar de que sean simples pericos informáticos que repiten lo que leen, ese  genera en robots que sean capaces de interconectar y relacionar variables entre millones y millones de datos para identificar nuevas tendencias y patrones que nosotros no hemos identificado, porque se encuentran lejanas unas de otras y no logramos relacionar su significado entre los millones de datos que existen, esto...

 Los mapas o grafos de conocimiento son una representación estructurada y conectada de información que modela las relaciones entre conceptos y entidades en un dominio disciplinar o temático específico. Este tipo de grafo no solo almacena datos, sino que también captura las relaciones semánticas y la contextualización del conocimiento. Cuando la información que contiene el grafo es insumo o producto de una investigación en biociencias le denomino BIOgrafo de conocimiento. Características Las características clave de un grafo de conocimiento son los nodos y las relaciones, los primeros representan entidades o conceptos, pueden ser personas, lugares, eventos, términos, etc. Los segundos describen las conexiones entre los nodos y pueden tener propiedades específicas, este es el caso de la relación "nació en" entre un nodo de persona y un nodo de lugar. Además están las bio-ontologías y la Web semántica. La primera describle y clasifica las clases, propiedades y relaciones en un d...

Pollia condensata es conocida comúnmente como "fruto de joya", es una planta de la familia Commelinaceae que es nativa de ciertas regiones de África tropical y subtropical. Se ha ganado su nombre común debido a los brillantes y vibrantes colores azules que exhiben sus frutos, que a menudo se asemejan a gemas preciosas o piedras preciosas. Estos colores excepcionales y brillantes se producen sin la presencia de pigmentos azules tradicionales, como antocianinas, lo que ha intrigado a científicos y botánicos. Los frutos de *Pollia condensata* son pequeños y redondos, generalmente de unos pocos milímetros de diámetro. Lo más destacado de estos frutos es su coloración brillante y metálica, que puede variar desde azules intensos hasta tonos de verde, violeta y rojo, dependiendo de la especie y la madurez del fruto. Estos colores se deben a la dispersión de la luz a través de una estructura celular altamente especializada en la superficie del fruto. La coloración inusual de los fru...

 El RDF (Resource Description Framework) es un estándar de la World Wide Web Consortium (W3C) diseñado para representar datos en la web de una manera que sea entendible tanto por humanos como por máquinas. El RDF se utiliza principalmente para describir relaciones entre recursos en la web y es fundamental en la construcción de la web semántica.  RDF es un estándar que permite representar datos en la web de manera estructurada y semántica mediante tripletas que describen relaciones entre recursos. Este formato es fundamental en la construcción de la web semántica, una extensión de la web actual que busca dar significado a los datos en la web, permitiendo una mejor interoperabilidad entre aplicaciones y máquinas al comprender el significado de los datos en la era de la información. El RDF organiza la información en tripletas, que consisten en tres partes: sujeto, predicado y objeto. Cada uno de estos elementos se identifica mediante una URI (Uniform Resource Identifier).  S...

La Web Semántica tiene como objetivo principal mejorar la forma en que se organiza, se accede y se comprende la información en línea. Para lograr esto, utiliza estándares y tecnologías específicas para dar significado a los datos en la web. Aquí se presentan algunos de los propósitos y beneficios clave de la Web Semántica: Organización de información: La Web Semántica permite una mejor organización de datos en línea al agregar metadatos estructurados y significado semántico a la información. Esto facilita la categorización y la búsqueda precisa de recursos. Búsqueda más precisa: Al proporcionar metadatos enriquecidos y significado semántico, la Web Semántica mejora la precisión de las búsquedas en línea. Los motores de búsqueda pueden comprender el contexto y la relación entre los datos, lo que resulta en resultados de búsqueda más relevantes. Integración de datos: Facilita la integración y el enlace de datos de diferentes fuentes y dominios. Esto es especialmente valioso en la creació...

¿El color azul de Aspicela scutata es producto de pigmentación o es color estructural? Esta es una excelente pregunta redactada en la siguiente entrada de mastodon por Ben Smith  e  https://sauropods.win/@twizzt/110930381816617763 Evidentemente, este es un caso que deberá resolver una detective en BIOinformación interesada en BIcolores haciendo investigación digital. La indagación consistirá  en localizar información científica precisa y confiable para responder esta pregunta, el procedimiento será buscar, leer, buscar, hasta en encontrar la respuesta.Voy a documentar el procedimiento para que sea replicable y otros lo puedan repetir, ademas voy a registrar las herramientas que utilizaré. Blogger para registrar el procedimiento Google Scholar para descubrir literatura académica Hypothes.is para anotar Mastodon para responder En principio, esta investigación tiene una primera complicación. Al parecer, hay algún problema con el nombre, porque aparece con ese nombre en...

El día 9 de junio del 2023 a las 11:00 horas presentaré la plática “ Web Semántica y Ontologías Aplicadas a Medicina Interna ” en Hospital General de México “Dr Eduardo Liceaga”, sera virtual por videocoferencia con duración de una hora. Es organizado por el servicio de Medicina Interna del hospital a través de la Coordinación de Educación a cargo del Doctor Javier Alonso Romero Bermúdez. Resumen La Web ha pasado por tres etapas que pueden definirse con base en la tecnología que se ha implementado así como en la manera en la que los usuarios la han aprovechado, se denominan Web 1.0, 2.0 o social y 3.0 llamada semántica. La Web semántica es la tercera generación en la historia de la Web, consiste en originar contenidos abiertos y estructurados en la Web con metadatos que asignan significado a la información para tener conjuntos de datos procesables por las computadoras que sean interoperables, reusables y que permitan generar mapas de conocimiento.  En la Web semántic...

La Web semántica consiste en generar contenidos en la Web que estén etiquetados y marcados con metadatos que describan el significado a través de tripletes, para esto se usa el lenguaje semántico RDF. Una vez estructurada la información semánticamente, es posible generar conjuntos de datos que sean procesables y realizar análisis y visualizaciones con ellos. SPARQL es el lenguaje diseñado para realizar consultas en un conjunto de RDFs. Estos son algunos recursos para buscar información entre los RDFs de Wikidata con SPARQL de forma amigable, de tal manera que se puede explorar todo el grafo de conocimiento construido y explorar la información de esta base de datos abierta, pública y colaborativa, que además está asociada a otros proyectos de la fundación Wikimedia como Wikipedia.   https://searchy.toolforge.org/ https://wikidata.metaphacts.com/ https://searchy.toolforge.org/ https://www.entitree.com/ http://kaiko.getalp.org/sparql https://wikidata.metaphacts.com/resource/app:LifeSc...