RDF biocolores

 El RDF (Resource Description Framework) es un estándar de la World Wide Web Consortium (W3C) diseñado para representar datos en la web de una manera que sea entendible tanto por humanos como por máquinas. El RDF se utiliza principalmente para describir relaciones entre recursos en la web y es fundamental en la construcción de la web semántica. 

RDF es un estándar que permite representar datos en la web de manera estructurada y semántica mediante tripletas que describen relaciones entre recursos. Este formato es fundamental en la construcción de la web semántica, una extensión de la web actual que busca dar significado a los datos en la web, permitiendo una mejor interoperabilidad entre aplicaciones y máquinas al comprender el significado de los datos en la era de la información.

El RDF organiza la información en tripletas, que consisten en tres partes: sujeto, predicado y objeto. Cada uno de estos elementos se identifica mediante una URI (Uniform Resource Identifier).

1.  Sujeto: Es el recurso principal al que se hace referencia.
2. Predicado: Describe la relación entre el sujeto y el objeto.
3. Objeto: Es el recurso relacionado con el sujeto a través del predicado.

Ejemplo de una tripleta en RDF

El pez mandarin tiene coloración azul

   - Sujeto: URI que identifica al pez mandarín https://www.wikidata.org/wiki/Q77062

   - Predicado: Una URI con la propiedad "Tiene color" https://www.wikidata.org/wiki/Property:P462

   - Objeto: Elemento color azul https://www.wikidata.org/wiki/Q54118

Consultas

Las consultas SPARQL sirven para recuperar datos almacenados en formato RDF, es un lenguaje de consulta para buscar, recuperar y manipular datos RDF.

Esta es la consulta con  todos los organismos a los que hemos asociado un color en Wikidata son casi 5000 registros!

https://w.wiki/7TRM

Mapas de conocimiento

Los grafos RDF están constituidos por los tripletas RDF se organizan en grafos, donde los nodos representan recursos y los bordes representan las relaciones entre ellos. Estos grafos permiten modelar información de manera flexible, estructurada y con significado.

Referencias

Bagnara, J. T., Fernandez, P. J., & Fujii, R. (2007). On the blue coloration of vertebrates. Pigment Cell Research, 20(1), 14-26. https://doi.org/10.1111/j.1600-0749.2006.00360.x

Goda, M., Fujiyoshi, Y., Sugimoto, M., & Fujii, R. (2013). Novel dichromatic chromatophores in the integument of the mandarin fish synchiropus splendidus. The Biological Bulletin, 224(1), 14-17. https://doi.org/10.1086/BBLv224n1p14

Fuente de la imagen: https://commons.wikimedia.org/wiki/File:Synchiropus_splendidus_2_Luc_Viatour.jpg