BIOgarabatos

 Durante el 2023 complete el reto de publicar al menos una entrada en mi Blog al día, he escrito más de 356 ideas, reflexiones y notas. Ha sido un gram ejercicio de escritura, integración y síntesis. Fuente de la imagen:  https://www.biodiversitylibrary.org/page/57675687

 Esta es una lista con documentos que vale la pena revisar para entender cómo fue el 2023 para la ciencia, entre estos, hay los números de revisión anuales con los descubrimientos más relevantes, los temas en boga y las selecciones imprescindibles: https://www.nature.com/immersive/d41586-023-03872-z/index.html https://www.nature.com/articles/d41586-023-03865-y https://www.nature.com/articles/d41586-023-03974-8 https://www.nature.com/immersive/d41586-023-03919-1/index.html https://www.science.org/content/article/breakthrough-of-the-year-2023

Una de las experiencias que resultan mas gratificantes de hacer investigación y ciencia son las colaboraciones, en el camino uno encuentra colegas geniales, con los que no solo es enriquecedor e inspirador trabajar, además es divertido y gratificante, algunos, con el paso del tiempo se convierten en grandes y queridos amigos. Mis amistades académicas constituyen una parte importante de mi vida, aquellas que son sinceras y permanentes, que además de alimentar mis ideas, activan mi pensamiento y enriquecen mi corazón, esas no tienen precio. Con algunos comparto ratos constantes de reflexiones, con otros hago reuniones intensas pero intermitentes, pero con todos disfruto enormemente crear, discutir, aprender y conversar. Gracias a todos mis colaboradores-amigos, sin Ustedes mi trabajo no tendría sentido y no sería igual.

 Realizar una investigación, generalmente es un proceso permanente y continuo, tanto el proceso, como los resultados requieren atención permanente, por eso es tan importante tener una buena autoregulación, planeación y organización para no colapsar.  Una de las tareas que requieren más atención es la publicación, una vez que se envía un documento a dictamen, se debe estar dispuesto a responder mensajes, realizar correcciones, hacer modificaciones y seguir el proceso de revisión por pares minuciosamente. Es común que se reciban notificaciones que se deben atender en fines de semana, días festivos, en vacaciones o incluso si uno está enfermo o indispuesto. Además, se deben responder pronto y ágilmente. Otra actividad común que se efectúa fuera de calendario de trabajo varias veces son los congresos, seminarios, diplomados o reuniones, que se efectúan en vacaciones y fines de semana, en especial las reuniones virtuales pueden ser en horarios nocturnos o de madrugada.

Pantone es una empresa reconocida a nivel mundial por su sistema de igualación de colores, que ha establecido estándares precisos y uniformes para la identificación y reproducción de colores en diversas industrias. Fundada en 1962, Pantone desarrolló un sistema de codificación numérica que asigna un número único a cada color, permitiendo una comunicación precisa y consistente en el diseño gráfico, la moda, la impresión y otras disciplinas creativas. Este sistema, conocido como el Sistema de Coincidencia de Colores Pantone (PMS, por sus siglas en inglés), se ha convertido en una herramienta esencial para profesionales que buscan lograr la coherencia y la reproducibilidad del color en sus proyectos, influyendo significativamente en la estandarización de la paleta cromática en todo el mundo. El Color del Año de Pantone es una elección anual que encapsula la esencia cultural y estética del momento, influenciando las tendencias en diseño, moda, arte y más. Cada año, los expertos en color de

 Sí, pero... Yes, But es una cuenta que presenta casos chuscos, contradictorios, aparentes, confusos e interesantes a través de imágenes, aquí hay algunos para BIOinformación Sí, ya funciona la inteligencia artificial, pero no sabemos usarla correctamente. Sí, existe Zotero para gestionar referencias, pero los alumnos no saben usarlo. Sí, hay muchos índices de citas académicos, pero los académicos los desconocen. Sí, la ciencia abierta está muy desarrollada en el mundo, pero no en nuestra región. Sí, el ORCID es muy útil para normalizar a los investigadores, pero no lo utilizamos en mi institución. Sí, hay en los perfiles de investigación están nuestras publicaciones, pero no están enlazados a nuestro perfil institucional. La tecnología es muy eficiente, pero tardan en responder los mensajes de correo semanas. Sí, ya terminó la tesis, pero los trámites administrativos son más complicados y tardados que la investigación. Sí, ya está aprobado el nuevo plan de estudios, pero el viejo nunc

Una anécdota es un relato breve de un acontecimiento extraño, curioso, sorpresivo o divertido, generalmente ocurrido a la persona que lo cuenta. Haré una colección de anécdotas interesantes, divertidas o singulares, que relatan los investigadores en los textos sobre biología del color. Referencias https://www.annualreviews.org/doi/abs/10.1146/annurev-vision-100419-120946 Fuente de la imagen:  https://www.biodiversitylibrary.org/page/42196271

Una licencia abierta es un conjunto de términos y condiciones legales que permiten a los creadores otorgar a otros usuarios el derecho de utilizar, compartir y modificar su obra de manera específica y flexible. Estas licencias están diseñadas para promover la colaboración y el intercambio de conocimientos al tiempo que protegen los derechos del autor. Los principios clave de las licencias abiertas incluyen la accesibilidad, la redistribución y la posibilidad de realizar cambios en la obra original. Al adoptar licencias abiertas, los creadores pueden contribuir al desarrollo de un entorno más colaborativo y accesible, fomentando la difusión de la información y la creatividad en diversos campos. Ejemplos comunes de licencias abiertas son las licencias Creative Commons, el dominio público y el software libre, que ofrecen una gama de permisos que van desde la simple atribución hasta la autorización para crear obras derivadas y compartir bajo condiciones similares. Creative Commons Una lice

Un taxón (plural: taxones) es una unidad de clasificación utilizada en la taxonomía, que es la ciencia de clasificar y organizar los seres vivos en categorías o grupos basados en sus similitudes y relaciones evolutivas. Los taxones representan niveles jerárquicos en un sistema de clasificación biológica que va desde categorías amplias y generales hasta categorías más específicas y detalladas. Estos niveles jerárquicos se organizan de manera que cada nivel superior incluye a los niveles inferiores.  Los taxones permiten a los científicos y biólogos organizar y comunicar información sobre la diversidad de la vida de manera sistemática y coherente. Cada organismo vivo está representado en esta jerarquía taxonómica, lo que facilita la comprensión de las relaciones evolutivas y las similitudes entre los diferentes seres vivos.  El nombre científico de la especie a la que corresponde el organismo con la coloración reportada es la variable más importante en la biocuración que hacemos sobre bi

Soy una investigadora interesada en entender la información, la literatura y los datos en biociencias en formato digital, usadas por humanos y computadas por ordenadores. Además de indagar las fuentes, los procesos, las herramientas y la manera en la que se utilizan, me ocupo en detectar la mejor manera de usarlas en el proceso enseñanza-aprendizaje de biólogos, médicos y biomédicos, especialmente a nivel licenciatura y posgrado. Promuevo la enseñanza activa, basada en habilidades, aprender haciendo y centrada en indagar, leer, escribir, diseñar preguntas y resolver problemas. Me importa trabajar con mis alumnos la integración, la curiosidad y la interdisciplina. Soy fan de la ciencia abierta, me encanta el español y me gusta colaborar con amigos, para hacer proyectos en equipo, interesantes y divertimos juntos, mientras aprendemos y resolvemos incógnitas.

Es la época de hacer listas, evaluar lo que se hizo, registrar éxitos y fracasos, aprender de los errores y disfrutar los éxitos de este año. Lo bueno Ya tenemos nube, portal y servicios básicos funcionando después del colapso que tuvimos porque nos quitaron el servicio institucional de Google. Mastodon se ha convertido en una excelente alternativa a Twitter y es aún mejor. La alternancia en la UNAM resultó tranquila. Estamos trabajando en proyectos muy interesantes. Se unieron al equipo tres grandes colaboradores. Empezamos dos cursos nuevos. Lo malo  Twitter estaba mal pero termino fatal, fue una gran pérdida. La AI puede tambalear muchas innovaciones tecnológicas. Va avanzando el nuevo plan de estudios de biología, pero no tiene una sola materia obligatoria sobre pensamiento crítico, lectura crítica, investigación digital, alfabetización informacional o literacidad académica. Lo feo Cada vez hay menos presupuesto para ciencia. Las guerras, no solo causan muertes, destrucción y pobre

 Desde hace más de dos años ya no incluyo en mis cursos plataformas de indices de citas como Web of Science y Scopus, en algún momento no nos quedó de otra, que usarlas y pagarlas, pues eran las únicas opciones disponibles de este tipo. Pero ahora con el desarrollo de interesantes iniciativas de referencias,  metadatos, resúmenes, referencias y citas abiertas esto ha cambiado y existen más y mejores alternativas a estas dos bases de datos tradicionales. De tal manera que, actualmente ninguna de las dos es importante, necesaria, ni estratégica, de hecho ya no ofrecen más que buena publicidad. Entre sus slogan están, "Potenciando el prestigio de ...", "El Factor de Impacto..." ¿La Sorbonna ya lo hizo, nosotros cuándo? Esta institución académica ha dejado de pagar WoS de Clarivate. La Web of Science es absolutamente innecesaria, únicamente sirve para alimentar egos, opino lo mismo de Scopus. Referencias https://opencitations.net/index https://www.sorbonne-universite.fr

  Pavoreal En el artículo de ( Ryan, 2021 ) aparece la siguiente frase “Más tarde, Darwin escribió una carta ahora famosa al botánico Asa Gray y se quejó de que "¡la vista de una pluma en la cola de un pavo real, cada vez que la miro, me enferma!" Ese fue el inicio de la historia de la selección sexual C. Darwin, “Carta 2743 del proyecto de correspondencia de Darwin” (Universidad de Cambridge, 1860). https: // www.darwinproject.ac.uk/ entrada 2743 . Ejercicio Verifica si esta cita es correcta, para hacerlo necesitas consultar la fuente primaria ¿Qué otras referencias hizo Darwin a los pavoreales? ¿Quién nombro a los pavoreales? ¿Cuál es el origen del color en las plumas de los pavoreales? ¿Que son los eyespots, cómo se originan y cuál es su función biológica? ¿Qué otras aves tienen eyespots, es un rasgo apomorfico o sinapomorfico (divergente o convergente)? ¿Qué otros organismos tienen eyespots y que tipo de proceso evolutivo los generaron? ¿Cómo se diferencian l

Hasta ahora la inteligencia artificial de texto generativa se basa principalmente en el modelo de lenguaje basado en procesamiento, son robots que se dedican a procesar y reescribir el lenguaje natural disponible en la Web. Pero la tecnología de la información actualmente está desarrollada mucho más que eso, ahora el reto es producir información estructurada y semántica, de tal manera que, sea posible generar nuevo conocimiento a partir de la información con significado que se ha creado en la web semántica, hacia allá vamos. Para explicar esto mas claramente, podría usar la alegoría de qué en lugar de que sean simples pericos informáticos que repiten lo que leen, ese  genera en robots que sean capaces de interconectar y relacionar variables entre millones y millones de datos para identificar nuevas tendencias y patrones que nosotros no hemos identificado, porque se encuentran lejanas unas de otras y no logramos relacionar su significado entre los millones de datos que existen, esto ser

Yo promuevo la ciencia abierta, por eso busco incesantemente  herramientas de código abierto, amigables, publicas y gratuitas para hacer y compartir los datos de mis investigaciones. En un principio utilicé Airtable porque es amigable, eficiente y permite compartir información, pero como suele suceder con estas compañías, conforme tienen éxito disminuyen las funciones libres, eliminan opciones abiertas y dificultan mantener las funciones, por eso he dejado de usarla.  Como siempre sucede en estos casos, eliminar una aplicación de mi caja de herramientas me obliga a buscar un sustituto, e invariablemente cuando esto pasa, el resultado es que encuentro una mejor aplicación. Hoy no fue la excepción, encontré una excelente alternativa llamada Baserow  https://baserow.io/  que estaré probando. Inscribirse fue sencillo y rápido. Pude importar muy fácilmente todas las bases de datos de Airtable, antes de que Airtable elimine su APP, porque ya publicaron sus sucias intenciones de hacerlo.

Brillo, una de las cualidades asociadas a la coloración en los organismos es el brillo. El brillo se ve como un reflejo similar a un espejo, es un rasgo asociado  a todos los organismos, desde las mariposas hasta ranúnculos, desde peces hasta moscas. La apariencia de los taxones con superficies brillantes está dominada por un destello, un pulso de luz brillante que sólo es visible bajo ángulos específicos de observación e iluminación. A diferencia de los objetos iridiscentes, cuyo color depende del ángulo de observación, los objetos brillantes suelen tener una apariencia brillante superpuesta a un color general (van der Kooi y Spaethe Los colores brillantes en los organismos son a menudo el resultado de pigmentos, estructuras especiales o propiedades ópticas que pueden tener diversas funciones en la ecología y la supervivencia de esos organismos. Aquí hay algunos ejemplos de colores brillantes en los organismos y sus posibles funciones: Colores Brillantes en Aves    - **Plumaje Brillan

 Este año mi top ten es el siguiente: Matodon 🏆 (El preferido de este año) Wikidata Hypothes.is https://hypothes.is/users/lmichan (La imprescindible) Zotero https://www.zotero.org/lmichan Baserow  https://baserow.io (Ya no uso Airtable) GitHub  https://mstdn.social/@lma Europe PMC Ala.mbre  https://ala.mbre.es/searxng/search Bibguides  https://community.libguides.com/ BHL  https://www.biodiversitylibrary.org/ ChatGPT (Se coló en la lista) Fuente de la imagen:  https://www.biodiversitylibrary.org/page/57675518

En esta lista anotaré artículos que he buscado de manera rápida y que no he localizado o no se han escrito.  Si después de hacer una búsqueda exhaustiva no existen, podrían ser investigaciones interesantes. En este caso listaré algunos para Bioinformación y Biocolores Origen del azul en Glaucus atlanticus . Función biológica de la luminiscencia de los escorpiones. El origen del color azul en  Aspicela scutata.

La  investigación digital es un campo multidisciplinario que utiliza herramientas y métodos digitales para recopilar, analizar y interpretar datos. Comprende diversas áreas, como la minería de datos, el análisis de big data y la inteligencia artificial. Los investigadores digitales emplean técnicas avanzadas para examinar patrones, identificar tendencias y extraer conocimientos significativos de conjuntos masivos de información académica, en muchos casos contenidos en biobases de datos.  La investigación digital desempeña un papel crucial en la actualidad, es un enfoque imprescindible porque es ubicuo y versátil, dado que la información electrónica es imprescindible, el uso de software disponible en la Web, simple o complejo, es obligado, lo que contribuye al avance científico abierto, replicable y transparente y la toma de decisiones basada en datos.  Participar en una investigación digital en ciencias médicas tiene como propósito generar nuevo conocimiento sobre datos, información, l