Wikimedia para Biocolores

 La fundación Wikimedia

Wikipedia es el proyecto más famoso de la fundación Wikimedia, pero todos los proyectos hermanos son muy interesantes que ofrecen una gran cantidad de recursos, algunos asociados a las entradas de la enciclopedía que son poco conocidos, que vale la pena conocer y utilizar porque son muy útiles y versátiles. Este es un breve un ejercicio que consiste en utilizar las diversas plataformas de Wikimedia para el proyecto Biocolores, que consiste en hacer experimentos de bioinformación de coloración y la visión del color desde la biología para hacer investigación digital.

Los dieciocho proyectos Wikimedia están relacionados, intercambian información, comparten herramientas, conforman un ecosistema virtual que tienen en común ser wikis que permiten leer, editar y buscar, todas son abiertas, colaborativas y políglotas, que ademas usan citas, referencias y datos ligados. Todas las iniciativas de la fundación Wikimedia  pueden clasificar con base en varios criterios, por ejemplo, el tipo de objeto digital que indexan, el nivel de estructuración de la información o el objetivo del proyecto, veamos esto con mas detalle.

Proyecto Biocolores consiste en un experimento de investigación digital. Parte de ese experimento implica utilizar las plataformas colaborativas y abiertas de la fundación Wikimedia.

El primer acercamiento que tienen los usuarios de internet a la información científica es la que aparece en Wikipedia por medio de las cajas resultado de la búsqueda en Google que se despliegan de Wikidata, de tal manera que, es indispensable que la información sobre temas científicos contenida en Wikipedia sea de calidad, verificada, actualizada, referenciada y escrita en un lenguaje claro y sencillo.

Nuestra propuesta consiste en implementar los servicios de la Fundación Wikimedia en la edición de contenidos y curación información digital sobre el biología del color, con propósito de utilizar y difundir el uso de estas plataformas para la investigación y la enseñanza virtual que integre los dominios de ciencia, la tecnología  y la información para promover las siguientes competencias informáticas e informacionales:

• Alfabetización informática e informacional
• Investigación Digital en Biociencias
• Ciencia Abierta, colaborativa y multilingue
• Generación de conocimiento estructurado y libre
• Producción de contenidos digitales en español
• Uso de referencias, citas y fuentes de información de calidad
• Biología in silico
• Procesamiento de información semántica: datos ligados, ontologías, RDF y SPARQL
• Utilización de bases de datos biológicas

Para alcanzar nuestros objetivos estamos produciendo materiales en línea, recursos didácticos e intervenciones didácticas dirigidas al público en general, así como a estudiantes de posgrado y licenciaturas de ciencias, en especial de biología. Entre las tareas que se pueden hacer para generar y curar información en las Wikis de Wikimedia sobre biología del color están:

• Subir contenidos multimedia a Wikimedia commons
• Editar las páginas de Wikipedia relacionadas con biología y visión del color
• Curar Wikidata para biología del color
• Participar en lexemas sobre color en los seres vivos
• Ligar información a Wikidata
• Contribuir con Wikiviajes

A nosotros nos interesan principalmente los proyectos de biología del color , relacionados y afínes que se han realizado en estas plataformas.

Proyectos BIOcolores

• Wikipedia (entradas): Enciclopedia explicaciones 
• https://en.wikipedia.org/wiki/The_Colours_of_Animals
• https://en.wikipedia.org/wiki/Animal_coloration
• https://en.wikipedia.org/wiki/Category:Warning_coloration
• https://en.wikipedia.org/wiki/Basics_of_blue_flower_colouration
• https://en.wikipedia.org/wiki/John_Gould
• https://es.wikipedia.org/wiki/Anexo:Colores
• https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_colors_by_shade
• https://en.wikipedia.org/wiki/Deimatic_behaviour
• https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_bioluminescent_organisms
• https://en.wikipedia.org/wiki/Category:Animal_coat_colors
• https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_animals_that_can_change_color
• https://en.wikipedia.org/wiki/Category:Blue_flowers
• https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Animals_by_color
• https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Blue_animals
• https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Blue_fish
• https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Blue_insects
• https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Plants_named_after_colours
• List of iridescent animals
• Wikidiccionario (Términos): Diccionario con definiciones de palabras
• Wikidata (Datos): base de datos conformada por declaraciones, cada declaración consta de un triplete elemento (Q) →propiedad (P) →elemento (E) y puede tener calificadores.
• https://www.wikidata.org/wiki/Q1075
• Wikispecies: catálogo de especies biológicas
• https://species.wikimedia.org/w/index.php?go=Go&search=blue&title=Special%3ASearch&ns0=1
• Wikimedia Commons: colección de archivos multimedia, imágenes, videos y sonidos
• https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Animals_by_color
• https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Colors_in_nature
• https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Organisms_by_color
• https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Buds_by_color
• https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Iridescent_plumage
• https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Colorful_birds
• https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Animals_by_color
• Wikisource
• https://en.wikisource.org/wiki/Wikisource:WikiProject_Open_Access/Programmatic_import_from_PubMed_Central/Red_fluorescence_increases_with_depth_in_reef_fishes_supporting_a_visual_function_not_UV_protection
• Wikilibros
• https://www.wikidata.org/wiki/Wikidata:WikiProject_Books/en

Lenguaje estructurado

El lenguaje estructurado cosiste en la información sistematizada por medio de formatos, estándares, identificadores y especificaciones que puede ser leída por humanos y puede ser procesada por máquinas. Cuando el texto solo puede ser leído por humanos se llama lenguaje natural, por ejemplo, Wikipedia está escrita en lenguaje natural (wikitexto) para ser leída y entendida por personas, mientras Wikidata y Wikispecies están escritas en lenguaje máquina pues utilizan el formato semántico, está estructuradas para ser leídas por personas y para ser procesada por máquinas, tanto así, que se pueden exportar los registros elegidos, para ser procesados en hojas de cálculo o por medio de algoritmos.

Nosotros cuando curamos la coloración de los organismos generamos consultas para filtrar la información que requerimos y entonces podemos extraerla y procesarla.

Fuente de la imagen: https://library.si.edu/image-gallery/71655

Bibliografía

• https://www.mediawiki.org/wiki/Structured_Data_Across_Wikimedia#:~:text=SDAW%20is%20a%20project%20that,projects%20and%20on%20the%20Internet.
• https://commons.wikimedia.org/wiki/Commons:Structured_data
• https://meta.wikimedia.org/wiki/Structured_data_for_GLAM-Wiki/Intro
• https://www.youtube.com/watch?v=CQsqdIJooYc