Ir al contenido principal

BIOcitology

Las citas son el hilo conductor del conocimiento en la ciencia, son las que registran los antecedentes y los consecuentes de las ideas utilizadas, determinan el detalle del flujo de la información obtenida de la literatura y archivan la historia de las fuentes utilizadas. En la literatura científica las citas se insertan en los párrafos de dos formas: cita textual (va entre comillas) o cita parafraseada, es una forma de relacionar un documento con otro, el procedimiento es el siguiente: el autor en el documento citante cita al documento citado y se agrega la referencia correspondiente. Hay distintas razones para citar una obra por ejemplo, confirmar, rechazar o cuestionar (ver presentación).

Es común explorar las referencias de un documento y contar la cantidad de citas que recibe o ubicar los documentos relacionados con base en la cocitación. El análisis de citas es un método de investigación cuantitativa propio para describir la evolución, la estructura y los patrones de las disciplinas, evaluar y predecir la tendencia del desarrollo científico. Una función clave del análisis de citas es descubrir relaciones entre las citas  a través de tres tipos de análisis básicos: co-cita, acoplamiento y cita cruzada. 

El análisis de citas es un método de investigación cuantitativa propio para describir la evolución, la estructura y los patrones de las disciplinas, evaluar y predecir la tendencia del desarrollo científico. Una función clave del análisis de citas es descubrir comunidades académicas de acuerdo con los comportamientos de citas de los autores. Implica principalmente tres tipos de análisis: co-cita, acoplamiento y cita cruzada. Las redes de conocimiento se conforman mediante las relaciones entre la literatura científica a través de las referencias (el pasado) y las citas (el futuro), así todo el corpus del conocimiento científico acumulado por medio de los artículos y los libros resultado de investigación, aquí hacemos algunos ejercicios que permiten visualizar las tendencias, las relaciones y la dinámica de estos componentes de la información sobre biología Unde (1971), el análisis de citas tiene tres aplicaciones principales:

1. Búsqueda y recuperación de información.

2. Evaluación cualitativa y cuantitativa de científicos, publicaciones e instituciones científicas.

3. Modelado del desarrollo histórico de la ciencia y la tecnología. 

 En un arduo trabajo un grupo encabezado por Silvio Peroni se han descrito con detalle la intención de las citas en la ontología de CiTO, este vocabulario  permite la caracterización de la naturaleza o tipo de las citas, objetivamente o retóricamente. de todos los tipos de citas bibliográficas utilizadas en los documentos, especialmente los académicos. De tal manera que es posible usarlos para definir el propósito de una cita determinada, que permita hacer análisis cualitativos y cuantitativos detallados sobre las citas. Esta ontología es parte de las llamadas ontologías SPAR (Presentación).

Esta manera de clasificar y describir los tipos de citas es una forma innovadora, muy útil y creativa de usar las citas,  muy lejana al simple factor de impacto o numero de citas, tan famosos. De hecho hay revistas que están utilizando CiTO para describir la intención de la cita con la que se hace una referencia (ver la bibliografía)

Las redes de conocimiento se conforman mediante las relaciones entre la literatura científica a través de las referencias (el pasado) y las citas (el futuro), así todo el corpus del conocimiento científico acumulado por medio de los artículos y los libros resultado de investigación me permiten realizar experimentos con las citas y sus referencias, a partir de las tendencias, las relaciones y las intenciones para visualizar la dinámica de las distintas dimensiones de la literatura especializada en biociencias contenida en las bases de datos abiertas producto del arduo trabajo de iniciativas como las citas y los resúmenes abiertos. Entre los fenómenos interesantes que se pueden estudiar están los siguientes

  • Intenciones de las citas
  • Errores de citación
  • Trabajos de alta calidad que no son citados porque se adelantan a su tiempo.
  • Artículos de baja calidad que son muy citados porque presentan controversias o errores.
  • Obras clásicas no citadas porque son obvias.
  • Los artículos de un campo muy especializado, específico o pequeño producen pocas citas, menos citas que un artículo de similar calidad en un campo más popular.
  • Citas de artículos retractados
  • Efecto Mateo y Bella Durmiente
  • Citación de los preprints
  • Citas de conjuntos de datos

Algunas preguntas de interés que me interesa responder con BIocitology

Es así que me interesa utilizar todo el potencial y la versatilidad que integran estos enfoques y metodologías de las citas para abordar temas de iteres en BIOohistoria y BIocolores como las siguientes:

  1. ¿Cuáles son las intensiones de citas del origen de las especies?
  2. ¿Cómo se han citado los trabajos de Wallace en la Biología del color?


Herramientas


Bibliografía

Shotton, D. (2010). Cito, the citation typing ontology. Journal of Biomedical Semantics, 1 Suppl 1(Suppl 1), S6. https://doi.org/10.1186/2041-1480-1-S1-S6

Peroni, S., & Shotton, D. (2012). FaBiO and CiTO: Ontologies for describing bibliographic resources and citations. Journal of Web Semantics, 17, 33-43. https://doi.org/10.1016/j.websem.2012.08.001

Peroni, S., Shotton, D. (2018). The SPAR Ontologies. In Proceedings of the 17th International Semantic Web Conference (ISWC 2018): 119-136. DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-030-00668-6_8



Fuente de la imagen: https://mastodon.social/@flameReactor/110905100760810808





Comentarios

Entradas populares de este blog

Bioinformación para ciencias físicas e ingeniería 2025

  Durante el semestre 2026-1 existe la opción de tomar el curso que impartiré en la carrera de Matemáticas Aplicadas de la Facultad de Ciencias de la UNAM. Modalidad:  virtual Material : computadora o laptop, cámara, micrófono e internet Día y hora : Lu-Vi 18:00 a 19:00 hrs Asistencia : 90% indispensable Características: Curso activo enfocado en la investigación y el uso de bioinformación, bioliteratura y biodatos. Herramientas básicas Recursos: https://start.me/p/q6x7Nn/infovestigacion y  https://start.me/p/ydG76P/culturacientifica Etiqueta: #BioinformacionMatematicasAplicadas https://mstdn.social/tags/BioinformacionMatematicasAplicadas Bibliografía:  https://www.zotero.org/groups/5990083/bioinformacionmatematicasaplicadas La idea es aprovechar al máximo las ventajas del formato virtual: la personalización, versatilidad y colaboración, por ejemplo. Vamos a utilizar información especializada en biociencias, herramientas informáticas para procesarla y analizar d...

Tecnología educativa en la era digital 2025

 Este año estoy preparando los contenidos para el curso de tecnología educativa versión 2025.  La tecnología informática en la educación es un tema actual y en evolución se refiere al uso de herramientas, recursos y técnicas tecnológicas digitales disponibles a través de la Web por medio de dispositivos electrónicos como la computadora persona para mejorar el proceso de enseñanza y aprendizaje. Esto incluye el uso de  hardware como la computadora personal, la laptop, la tableta o el celular inteligente, y software como programas,  plataformas en línea, software educativo, aplicaciones móviles, y otros recursos digitales que facilitan la interacción entre los estudiantes y los contenidos, así como la gestión y evaluación de su aprendizaje. La tecnología educativa no solo abarca los dispositivos y el software, sino también los currícula, los métodos, los instrumentos, los procesos, los estándares pedagógicos que integran estas herramientas para hacer más efectivo el pr...

Escarabajos de colores

En los coleópteros los rasgos de coloración están en el exoesqueleto de quitina y en los élitros, las investigaciones de la biología del color de este taxón se centra en el caparazón que funciona para la comunicación, el camuflaje o la atracción sexual. Los escarabajos adquieren su coloración por medio de pigmentos y color estructural, esta combinación y su distribución en el exoesqueleto determinan una amplia gama de colores y patrones como manchas y líneas en tonos mate y brillosos que resultan fascinantes y varían ampliamente entre las diferentes especies. Algunos escarabajos pueden tener colores metálicos debido a estructuras microscópicas en su caparazón que refractan la luz, en lugar de pigmentos directos. Los pigmentos en los coleópteros, como en muchos otros organismos, pueden variar ampliamente entre especies y aún dentro de una misma especie, pero corresponden a alguno de los siguientes tipos: 1. **Melanina:** Este es un pigmento común que produce colores negros, marrones y g...