Ir al contenido principal

Fuentes de biobases de datos

Las herramientas por excelencia para la investigación en biociencias in silico  son, sin duda, las bases de datos; estás constituyen la principal fuente de información para recuperar procesar y visualizar datos, información y literatura. Constan de colecciones de datos, con identificadores únicos, alojadas en un software que facilita la sistematización de información comúnmente en tablas conformadas por campos y registros de datos y la asignación de metadatos.

Cada base de datos tiene un propósito específico y cuando es académica porque es resultado de investigación generalmente ha sido descrita en una publicación científica. Hay miles de bases de datos y comúnmente no es fácil localizarlas. A continuación agrego una lista de fuentes en donde se reúnen conjuntos de bases de datos que pueden ser utilizadas para investigación en ciencias de la vida, de la salud relacionadas y afines. 

Siempre resulta útil tener reunidas las bases de datos de una especialidad o un dominio de interés para conocerlas y utilizarlas.


Fuentes que reúnen bases de datos de interés para biociencias

https://biopragmatics.github.io/biomappings/

https://ngdc.cncb.ac.cn/databasecommons/search

https://bio.tools/t?page=1&q=database&sort=score

https://scicrunch.org/resources/Tools/source/nlx_144509-1/search?q=Database&l=Database&facet[]=Resource%20Type%3Adatabase

https://fairsharing.org/search?fairsharingRegistry=Database

https://www.oxfordjournals.org/nar/database/search/

https://bioregistry.io/

https://lod-cloud.net/

https://biopragmatics.github.io/bioregistry/curation/

https://w.wiki/4i9m

https://registry.identifiers.org/registry

https://www.re3data.org/search?query=database&subjects%5B%5D=2%20Life%20Sciences

https://bdj.pensoft.net/article/32765/element/4/4905550//

https://biodbnet.abcc.ncifcrf.gov/

https://www.catalogueoflife.org/data/source-datasets

https://riojournal.com/article/14059/




Comentarios

Entradas populares de este blog

Bioinformación para ciencias físicas e ingeniería 2025

  Durante el semestre 2026-1 existe la opción de tomar el curso que impartiré en la carrera de Matemáticas Aplicadas de la Facultad de Ciencias de la UNAM. Modalidad:  virtual Material : computadora o laptop, cámara, micrófono e internet Día y hora : Lu-Vi 18:00 a 19:00 hrs Asistencia : 90% indispensable Características: Curso activo enfocado en la investigación y el uso de bioinformación, bioliteratura y biodatos. Herramientas básicas Recursos: https://start.me/p/q6x7Nn/infovestigacion y  https://start.me/p/ydG76P/culturacientifica Etiqueta: #BioinformacionMatematicasAplicadas https://mstdn.social/tags/BioinformacionMatematicasAplicadas Bibliografía:  https://www.zotero.org/groups/5990083/bioinformacionmatematicasaplicadas La idea es aprovechar al máximo las ventajas del formato virtual: la personalización, versatilidad y colaboración, por ejemplo. Vamos a utilizar información especializada en biociencias, herramientas informáticas para procesarla y analizar d...

Tecnología educativa en la era digital 2025

 Este año estoy preparando los contenidos para el curso de tecnología educativa versión 2025.  La tecnología informática en la educación es un tema actual y en evolución se refiere al uso de herramientas, recursos y técnicas tecnológicas digitales disponibles a través de la Web por medio de dispositivos electrónicos como la computadora persona para mejorar el proceso de enseñanza y aprendizaje. Esto incluye el uso de  hardware como la computadora personal, la laptop, la tableta o el celular inteligente, y software como programas,  plataformas en línea, software educativo, aplicaciones móviles, y otros recursos digitales que facilitan la interacción entre los estudiantes y los contenidos, así como la gestión y evaluación de su aprendizaje. La tecnología educativa no solo abarca los dispositivos y el software, sino también los currícula, los métodos, los instrumentos, los procesos, los estándares pedagógicos que integran estas herramientas para hacer más efectivo el pr...

BIOinformación para BIOtecnología

 BIOinformación para investigación y práctica digital en BIOtecnología Recientemente hemos recibido un buen número de estudiantes de biotecnología  interesados en realizar su servicio social, su práctica profesional o su tesis en el laboratorio de BIOinformación. La biotecnología investiga e innova en las aplicaciones técnicas de la biología (Ng & Peh, 2010) es un campo de investigación en evolución que cubre una amplia gama de temas (Yeung et.al., 2019). Para investigar y practicar la biotecnología es indispensable tener habilidades básicas y de conocer los conceptos, teorías y métodos asociados a la bioinformación es necesario aprender competencias como la planeación y la recuperación de bibliografía de manera adecuada, es deseable identificar las principales características de la literatura especializada, conocer los recursos digitales disponibles y adecuados para manejar la literatura (Bauer, 2009), utilizar correctamente las colecciones bibliográficas, gestionar su bi...