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Gene ontology en la literatura de biociencias

Gene Ontology

Si eres biólogo, médico o biomédico y no conoces Gene Ontology es momento de hacerlo!!!

🧬Para investigación

🧬Para enseñanza

🧬Para consultar bibliografía

🧬Para hacer anotaciones

🧬Es una de las herramientas más importantes de la Biología actual sin la menor duda

🧬Es un buen ejemplo para abordar temas como E-ciencia, integración de conocimiento, multidisciplina, colaboración internacional, normalización, interoperabilidad, acceso abierto, web semántica, anotación en biobases de datos y biocuración.

Gene Ontology es la bio-ontología más utilizada en las biociencias, fue la primer ontología de gran envergadura realizada en el dominio biomédico, es mantenida por un consorcio de especialistas, la información de este vocabulario se obtiene de experimentos y de la biocuración de literatura, se centra en tres cualidades de los genes: las funciones moleculares, las ubicaciones celulares y los procesos que pueden llevar a cabo los productos génicos.

Bases de datos académicas de referencias y citas

Si quiero localizar literatura especializada en biomedicina sobre este tema puedo utilizar muchas aplicaciones que contienen millones de registros, son abiertas, interactivas y dinámicas, y que resultan más sofisticadas y modernas que las bases de datos bibliográficas que se usan comúnmente en ciencia: Web of Science y Scopus, que son las más antiguas, cerradas y de tradición, que solo podemos consultar a través de el servicio bibliotecario de la UNAM quien paga la millonaria suscripción a estos servicios.

Pero actualmente hay una gran cantidad de alternativas, aquí pongo una lista de las herramientas que más me gustan para explorar literatura porque tienen muchas opciones para procesar y visualizar la literatura, contienen muchas información e incluso algunas están asociadas a ontologías , aquí lo hago para "Gene Ontology". En el momento que escribo esta entrada en PubMed existen 35,226 resultados para la consulta "gene ontology" en PubMed https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/?term=%22gene+ontology%22, 75 están en el título.

  1. https://app.dimensions.ai/discover/publication?search_mode=content&search_text=%22gene%20ontology%22&search_type=kws&search_field=full_search
  2. https://www.lens.org/lens/search/scholar/list?q=%22gene%20ontology%22
  3. https://www.semanticscholar.org/search?q=gene%20ontology%22&sort=relevance
  4. https://openknowledgemaps.org/map/58f52c5039c5b46276bc6f587510829f
  5. https://europepmc.org/search?query=%22gene%20ontology%22





Bibliografía


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