Ir al contenido principal

Investigación Biológica: Biocolores

 El proyecto BIOcolores consiste en un experimento in silico para investigar los datos, la literatura, la información y el conocimiento especializados disponibles en la Web sobre la biología y la visión del color en todas sus dimensiones y en los distintos niveles de complejidad. Nuestro objetivo es identificar las mejores maneras de generar, procesar, visualizar y compartir información en biociencias para obtener nuevo conocimiento abierto, estructurado y con significado, implementando herramientas informáticas de vanguardia como los datos ligados, la web semántica, las ontologías, la minería, los grandes datos, el análisis de redes y la cienciometría.

Es un proyecto que integra distintas dimensiones y dominios disciplinares para investigar la obtención de nuevo conocimiento en biociencias, se centra en entender los datos, la literatura, la información, los procesos y las herramientas informáticas para analizarlos y visualizarlos, participan en el proyecto biólogos, matemáticos y computólogos. La investigación biológica implica distintas aproximaciones, métodos, técnicas y enfoques, estudiar la información biológica es una buena manera de estudiar cada uno de estos elementos, veamos algunos.

Nuestro principal interés es colaborar en un contexto multi, intra y transdisciplinario que nos permita generar interconecciones teóricas y metodológica en las que se fomenten la investigación en línea, el uso del entorno virtual en todo su potencia, el intercambio de ideas, la exploración de aproximaciones singulares, distintas, creativas e innovadoras. Nos interesa especialmente promover la ciencia para todos, abierta, colaborativa, equitativa y en español.

Como parte de nuestra investigación exploramos las distintas maneras en las que podemos generar información semántica sobre biología del color sobre temas de pigmentación respecto a los datos sobre variables que es posible anotar en los artículos científicos electrónicos para investigar sobre biocolores,  las siguientes:


Enfoques

  • Fisiología. Los pigmentos en la piel, el pelaje, las plumas y otros tejidos de los organismos. 
  • Evolución. Se analiza cómo y por qué los colores se han desarrollado y evolucionado en diferentes especies a lo largo del tiempo. Esto puede estar relacionado con la selección sexual, la camuflaje, la advertencia y otros factores. Además, se analizan las adaptaciones específicas de coloración en diferentes entornos y especies, desde el color de las plantas en función de la fotosíntesis hasta el color de los animales acuáticos en función de la absorción de luz.
  • Ecología. La coloración puede desempeñar roles importantes en la ecología de un organismo, como el camuflaje para evitar a los depredadores o el mimetismo para parecerse a otras especies peligrosas. La biología del color investiga estas funciones y adaptaciones.
  • Comunicación. Los colores también se utilizan para la comunicación intraespecífica, como señales de cortejo, territorialidad o jerarquía social. Estudia cómo los organismos utilizan los colores para transmitir información a otros de su misma especie.
  • Biofísica. Explora la física de cómo la luz interactúa con las estructuras y pigmentos en los tejidos biológicos para crear color. Esto puede incluir fenómenos como la iridiscencia y la polarización de la luz.
  • Conducta. La biología del color investiga cómo la percepción y la respuesta de los organismos al color influyen en su comportamiento, como la preferencia de pareja o la elección de alimentos.
  • Genética. La genética de la coloración se refiere al estudio de cómo los genes influyen en la determinación de los colores y patrones de color en organismos vivos. La coloración es una característica fenotípica que varía ampliamente en el reino animal y vegetal, y está controlada por una serie de genes y factores genéticos que interactúan de manera compleja. La expresión de genes relacionados con la coloración está regulada por procesos de activación y represión génica. Factores epigenéticos y ambientales también pueden influir en la expresión de genes de coloración. polimorfismo se refiere a la existencia de múltiples formas de un gen en una población. En algunos casos, el polimorfismo genético puede llevar a la presencia de diferentes colores o patrones de color en individuos de la misma especie.
  • Hibridación. La hibridación de coloración se refiere a la mezcla de características de color de dos individuos o especies diferentes en su descendencia híbrida. Este fenómeno puede ocurrir en una variedad de organismos, incluyendo plantas, animales e incluso microorganismos. La hibridación de la coloración puede dar lugar a patrones de color únicos y sorprendentes en la descendencia que difieren de los patrones de color de los progenitores originales.  Este proceso es muy común e peces, flores y mariposas, por ejemplo.
  • Biodiseño. El biodiseño se basa en el estudio de la naturaleza y la emulación de sus soluciones eficientes y sostenibles. El color en la naturaleza desempeña un papel crucial en la supervivencia y la adaptación de los organismos. Los diseñadores pueden inspirarse en los colores de la flora y fauna para crear productos y sistemas eficientes y sostenibles. 


Tipo de experimentación

  • In vivo
  • In vitro
  • In silico

Métodos basados en información

  • Bioinformática
  • Museómica
  • Bibliómica
  • Cienciometría
  • Revisiones sistemáticas

Fuentes de información

  • Literatura
  • Referencias y citas
  • Bases de datos biológicas
  • Ontologías
  • Imágenes
  • Datos


La biología del color es un excelente tema de las biociencias que nos permite realizar experimentos para entender las singularidades de la información en distintas dimensiones, contextos, modelos, fuentes y herramientas.



Fuentes de la imagen: https://commons.wikimedia.org/wiki/File:African_emerald_cuckoo_(Chrysococcyx_cupreus)_male.jpg


Comentarios

Entradas populares de este blog

Test de investigación digital

Cuando se empieza un curso o entrenamiento primero es importante hacer un diagnóstico para identificar las debilidades, las fortalezas y las áreas de oportunidad, este es un test que utilizo en las clases para evaluar el conocimiento sobre los conceptos, métodos y herramientas más relevantes de la investigación digital, al final los resultados se comparan con la checklist de los contenidos del curso. Esta es la liga al ejercicio Test de investigación digital .

Paletas de colores bioinspiradas educatic2024

 Hemos mandado una ponencia al encuentro 10° Encuentro universitario de mejores prácticas de uso de TIC en la educación educatic2024  que se llevará a cabo en modalidad híbrida del 23 al 26 de julio de 2024, este es un evento abierto al cual se puede asistir generando una cuenta en el portal  https://encuentro.educatic.unam.mx/ . Esta reunión organizada por la Dirección General de Cómputo y de Tecnologías de Información y Comunicación (DGTIC), a través de la Dirección de Innovación en Tecnologías para la Educación (DITE) tiene como objetivo para compartir experiencias y reflexiones en torno a la importancia de su intervención docente en procesos educativos en los que ha integrado tecnologías digitales. Nuestra participación consiste en un texto reflexivo que se denomina “Paletas de colores bioinspiradas” en el que enfatizamos en el lado humano de la tecnología y su rol docente en un proyecto que integra la Bioinspiración, la Biología del Color y las TICs y es posible asistir con los si

Citas y su significado, o por qué citamos (Silvio Peroni)

El día de hoy asistí a la sesión de entrenamiento de Graspos sobre Citas y su significado, o por qué citamos, con Silvio  Peroni ( Universidad de Bolonia)  @essepuntato 23 de julio 2024 disponible en https://graspos.eu/training-material . Objetivos de entrenamiento:   Comprender las diferentes dinámicas detrás de las citas Explorar modelos ontológicos para la caracterización de citas Obtenga los conceptos básicos sobre el uso de una herramienta para inferir dicha caracterización de citas. Los resultados del aprendizaje Al final de la sesión, el participante comprenderá la importancia de la semántica de citas, aprenderá sobre modelos ontológicos dedicados a describir dicha semántica y finalmente podrá utilizar una herramienta para extraer la semántica de citas. Materiales Estos son algunos materiales que exploré y reuní durante la sesión para revisarlas con detalle posteriormente. https://sparontologies.github.io/cito/current/cito.html h ttps://scholia.toolforge.org/ https://github.c