En la biología del color son importantes dos dimensiones de estudio, el origen del color y la función del color. Uno de los orígenes del color en los seres vivos es la bioluminiscencia, esta cualidad de la luz junto con el color estructural y los pigmentos, constituyen las diferentes maneras en las que los organismos producen colores.
La función biológica del color implica el papel que tiene la coloración en las diferentes facetas anatómicas, funcionales, ecológicas y evolutivas. Por ejemplo, hablemos de la defensa, el color es un elemento que permite a los seres vivos montar respuestas para evitar el ataque por medio de estrategias como el camuflaje, el mimetismo y el aposematismo.
El aposematismo implica avisar a los depredadores con señales como un color llamativo que existe alguna desventaja asociada que puede ser una toxina que produzca malestar o la muerte, de esta manera los depredadores evitarán a la presa.
En este caso estamos investigando la bioinformación en referencia a los organismos que reúnen ambos elementos: la bioluminiscencia con una función aposemática, son pocos los casos reportados que tengan ambas características, quizás cerca de 50 y no existe hasta el momento alguna revisión de todos ellos, por lo que constituye un tema de estudio interesante y singular, vamos allá.
Estudiar la información constituye una forma de realizar biología in silico, implica utilizar las distintas dimensiones informativas como, datos, imágenes y literatura por ejemplo. En este caso elegimos estudiar la literatura especializada que se ha publicado desde las biociencias entre la intersección del aposematismo y la bioluminiscencia, la idea es probar distintas herramientas que permitan integrar, curar, enriquecer y visualizar los artículos científicos, para cual hemos seguido este procedimiento.
- Reunir todos los artículos académicos que hagan referencia a uno o más organismos con aposematismo y bioluminiscencia.
- Identificar todas aquellas herramientas que potencien el manejo de la literatura para reunirla, clasificarla, describirla y procesal utilizando tecnología abierta, interoperable, multilengua, colaborativa e innovadora.
- Generar un protocolo para organizar y procesar la información de manera automática.
- Para descubrir la literatura sobre el tema identificamos dos herramientas relevantes: Google Scholar y Lens
- La literatura seleccionada se reúne en el gestor de bibliografía Zotero
- A continuación toda la bibliografía se publica en Wikidata para mantener los metadatatos abiertos y disponibles para realizar mapas de conocimiento con tecnología semántica y ligada. Para esta fase se utilizó el complemento de Cita de Wikidata.
- Publicar una revisión de literatura sobre el tema, en el que se exploren los taxones, las funciones de la coloración, distribución y tipo de toxina, por ejemplo.
Presentación manejo de literatura aposematismo y bioluminiscencia
Fuente de la imagen: https://en.wikipedia.org/wiki/Motyxia#/media/File:Glowing_millipede.jpg
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