Biopigmentos en Wikidata

Como parte de las descripciones sobre coloración en los seres vivos curamos los pigmentos que producen la coloración, el procedimiento es el siguiente:

Localizar en la literatura un pigmento responsable de un tono de color
Localizar el producto natural en wikidata
Corroborar si está clasificado como pigmento, si no lo está se agrega.
Relacionar el taxón y el color al que hacen referencia.

En un futuro exploraremos la manera de agregar otras variables como el gen que sintetiza el pigmento y el tipo celular en el que se localiza.

Curar esta información es todo un reto por las siguientes razones porque varía mucho la nomenclatura de las sustancias químicas y eso dificulta encontrar la información, para identificar los pigmentos utilizamos bases de datos de sustancias químicas como PubChem y LOTUS.

LOTUS

Una de las bases de datos que están en nuestra lista de biobases de datos biológicas con aplicación para el proyecto BIOcolores es LOTUS mantenida por el proyecto LOTUS. Esta base de datos reúne información útil sobre los pigmentos que encontramos en la literatura y nos permite realizar las siguientes funciones.

Identificar el nombre de los pigmentos
Conocer sus características generales
Localizar la liga del pigmento en Wikidata

Comentarios

Entradas populares de este blog

Taller Informática para la historia de las ciencias

Taller Informática para historia de las ciencias En unos días voy a impartir el taller de Informática para historia de las ciencias en el que haremos una revisión exhaustiva, minuciosa, detallada y profunda de la información y la informática en la investigación sobre historia de las ciencias. Organizado por el Seminario Universitario de Historia, Filosofía y Estudios de las Ciencias y la Medicina ( SUHFECIM ) dependiente de la Secretaría de Desarrollo Institucional (SDI) de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM). https://suhfecim.sdi.unam.mx/ . Es una entidad institucional de la Universidad Nacional Autónoma de México, creada en abril de 2021 por la Rectoría y dependiente de la Secretaría de Desarrollo Institucional (SDI) para dedicar un espacio al análisis, la reflexión, la investigación, la difusión y la divulgación de la interacción en temas sobre Historia, Filosofía, Medicina y Estudios de las Ciencias a nivel mundial. Detalles del curs...

Bibliografía para biología comparada

Ya está disponible la colección de la bibliografía para el curso de Fundamentos de biología comparada de la licenciatura de Biología del nuevo plan de estudios de la Facultad de Ciencias, UNAM aprobado en el 2024. Esta colección tiene cómo propósito gestionar la literatura en una colección digital, abierta, interoperable que permita integrar todas las fuentes, generar bibliografías y producir citas y referencias. Utilizar la bibliografía a través de una colección digital, estructurada con metadatos y bien curada representa una estrategia con varias ventajas que facilitará el uso de información automatizada, actualizada e inmediata y facilita asegurar que los estudiantes utilicen fuentes de calidad y que se familiaricen con los distintos tipos de fuentes. Para generar la bibliografía privilegie el uso de identificadores como ISBN para libros, ISSN para revistas y DOI para los artículos con la finalidad de que los metadatos se obtuvieran de manera automática y estuvieran actualiz...

Manejo de información en innovación educativa

Manejo de información para el desarrollo de proyectos de innovación educativa La innovación educativa La innovación educativa se refiere a la aplicación de nuevas teorías, métodos, ideas, prácticas o técnicas para mejorar el proceso de enseñanza-aprendizaje significativamente. Manejo de información en innovación educativa El manejo de información en innovación educativa en la era digital consta de todos los procesos necesarios para gestionar, tanto la información que constituye el insumo como el producto del ciclo de una práctica educativa. Incluye las herramientas, los procesos, los protocolos, las especificaciones y las buenas prácticas implementadas en un proyecto determinado que puede ser a nivel mundial, ya sea realizado por instituciones, organizaciones, entidades, grupos o individuos interesados en generar información y datos de calidad accesibles, interoperables, abiertos y reusables para aprovecharlos en todo su potencial. Este es un proceso estratégico para la innovación...

BIOgarabatos

Buscar este blog