Como parte de las descripciones sobre coloración en los seres vivos curamos los pigmentos que producen la coloración, el procedimiento es el siguiente:
- Localizar en la literatura un pigmento responsable de un tono de color
- Localizar el producto natural en wikidata
- Corroborar si está clasificado como pigmento, si no lo está se agrega.
- Relacionar el taxón y el color al que hacen referencia.
En un futuro exploraremos la manera de agregar otras variables como el gen que sintetiza el pigmento y el tipo celular en el que se localiza.
Curar esta información es todo un reto por las siguientes razones porque varía mucho la nomenclatura de las sustancias químicas y eso dificulta encontrar la información, para identificar los pigmentos utilizamos bases de datos de sustancias químicas como PubChem y LOTUS.
LOTUS
Una de las bases de datos que están en nuestra lista de biobases de datos biológicas con aplicación para el proyecto BIOcolores es LOTUS mantenida por el proyecto LOTUS. Esta base de datos reúne información útil sobre los pigmentos que encontramos en la literatura y nos permite realizar las siguientes funciones.
- Identificar el nombre de los pigmentos
- Conocer sus características generales
- Localizar la liga del pigmento en Wikidata
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